Файл PDB (що це таке і як його відкрити)

А файл з PDB розширення файлу швидше за все, це файл бази даних програми, який використовується для зберігання налагоджувальної інформації про програму чи модуль, наприклад DLL або EXE файл. Їх іноді називають файлами символів.

Файл зіставляє різні компоненти та інструкції у вихідному коді в остаточний скомпільований продукт, який налагоджує потім можна використовувати для пошуку вихідного файлу та розташування у виконуваному файлі, у якому він повинен зупинити налагодження процес.

Натомість деякі файли PDB можуть мати формат файлу Protein Data Bank. Ці прості текстові файли які зберігають координати щодо білкових структур.

Інші файли PDB, ймовірно, створюються у форматі файлів Palm Database або PalmDOC і використовуються з мобільним PalmOS операційна система; деякі файли в цьому форматі замість цього використовують розширення файлу .PRC. Ще один можливий формат – Tanida Demo Builder.

Знімок екрана кількох файлів PDB у Windows 10, які відкриваються за допомогою Блокнота

Як відкрити файл PDB

Різні програми використовують власний файл PDB для зберігання даних у якомусь структурованому форматі бази даних, тому кожна програма використовується для відкриття власного типу.

Геніальний, Прискорюй, Visual Studio, і Пегас це лише кілька прикладів програм, які можуть використовувати файл PDB як файл бази даних. Radare і PDBparse може також працювати.

Деякі файли PDB зберігаються як звичайний текст, як-от файли Geneious Program Debug Database, і є повністю зрозумілими людиною, якщо їх відкрити в текстовий редактор. Ви можете відкрити цей тип файлу PDB за допомогою будь-якої програми, яка може читати текстові документи, як-от вбудована програма Блокнот у Windows. Деякі інші засоби перегляду та редактори файлів PDB включають Блокнот++ і Дужки.

Інші файли PDB не є текстовими документами і корисні лише тоді, коли їх відкривають за допомогою програми, для якої вони призначені. Наприклад, якщо ваш якимось чином пов’язаний з Quicken, спробуйте використовувати це програмне забезпечення, щоб переглянути або відредагувати його. Visual Studio очікує побачити файл PDB в тій самій папці, що й файл DLL або EXE.

Ви можете переглядати та редагувати файли PDB, які є файлами Protein Data Bank, у Windows, Linux та macOS за допомогою Авогадро. Ці програми також можуть відкривати файл: Jmol, RasMol, QuickPDB, і USCF Химера. Оскільки це звичайний текст, ви також можете відкрити його в текстовому редакторі.

Palm робочий стіл повинен мати можливість відкрити цей файл, якщо він у форматі файлу Palm Database, але, можливо, вам доведеться спочатку перейменувати його, щоб мати розширення файлу .PRC, щоб ця програма розпізнала його. Калібр це інший варіант.

Щоб відкрити файл PalmDOC PDB, спробуйте Переглядач STDU.

Файли Tanida Demo Builder відкриваються за допомогою a програма з такою ж назвою.

Як конвертувати файл PDB

Файли бази даних програми, швидше за все, не можна конвертувати в інший формат файлу, принаймні, за допомогою a звичайний інструмент для конвертації файлів. Натомість, якщо є будь-який інструмент, який може конвертувати файл такого типу, це буде та сама програма, яка може його відкрити.

Наприклад, якщо вам потрібно конвертувати файл бази даних із Quicken, спробуйте зробити це за допомогою цієї програми. Однак цей тип перетворення, ймовірно, не тільки мало корисний, але й не підтримується в них програми баз даних (тобто вам, ймовірно, не потрібно конвертувати цей тип файлу PDB в будь-який інший формат).

Файли Protein Data Bank можна конвертувати в інші формати за допомогою MeshLab. Для цього вам, можливо, доведеться спочатку конвертувати його в WRL за допомогою PyMOL від Файл > Зберегти зображення як > VRML меню, а потім імпортуйте файл WRL до MeshLab і використовуйте файл Файл > Експортувати сітку як меню, щоб остаточно перетворити файл PDB у STL або інший формат файлу.

Якщо вам не потрібно, щоб модель була кольоровою, ви можете експортувати файл безпосередньо в STL за допомогою USCF Chimera (посилання для завантаження наведено вище). В іншому випадку ви можете використовувати той самий метод, що й вище (з MeshLab), щоб перетворити PDB на WRL за допомогою USCF Chimera, а потім експортувати WRL до STL за допомогою MeshLab.

Щоб перетворити PDB у PDF або EPUB, якщо у вас є файл PalmDOC, це можливо кількома способами, але найпростішим є використовувати онлайн-конвертер, наприклад Замзар. Ви можете завантажити свій файл на цей веб-сайт, щоб мати можливість конвертувати його в ці формати, а також у AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT та інші формати файлів електронних книг.

Перетворення файлу PDB у формат FASTA можна зробити за допомогою Онлайн-конвертер PDB в FASTA від Meiler Lab.

Також можна конвертувати цей файл у CIF (формат кристалографічної інформації) онлайн за допомогою PDBx/mmCIF.

Все ще не вдається відкрити файл?

Файли, які не відкриваються жодним із інструментів зверху, ймовірно, насправді не є файлами PDB. Можливо, ви неправильно читаєте розширення файлу; деякі формати використовують суфікс, який дуже нагадує PDB, коли вони дійсно не пов’язані і не працюють однаково.

Наприклад, PDF-файл є файлом документа, але більшість програм, наведених вище, не відображатимуть текст та/або зображення правильно, якщо ви спробуєте відкрити його за допомогою цих програм. Те ж саме стосується інших файлів із подібним написанням розширення, наприклад DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO та WPD файлів.

PBD є ще одним, що належить до Резервне копіювання завдань EaseUS програму і, отже, корисний лише тоді, коли відкривається за допомогою цього програмного забезпечення.

Якщо у вас немає файлу PDB, перегляньте розширення файлу, яке має ваш файл, щоб знайти відповідну програму, яка його відкриває або перетворює.

Розширене читання файлів PDB

Ви можете прочитати набагато більше про файли програмної бази даних GitHub і Wintellect.

Про файли Protein Data Bank також можна дізнатися більше; побачити Всесвітній банк даних білка і ПБД РЦСБ.

Питання що часто задаються

  • Як виправити це, коли Visual Studio не може знайти або відкрити файли PDB? Якщо ви бачите повідомлення про те, що Visual Studio не може знайти або відкрити файл PDB, спробуйте скористатися інструментом налагодження Visual Studio. Йти до Інструменти > Параметри > Налагодження > символи і виберіть Сервери символів Microsoft.
  • Як відкрити файл PDB на Android? Щоб відкрити файл PDB на Android, скористайтеся стороннім зчитувачем файлів. Завантажте програму Cool Reader або будь-який інший засіб для читання файлів PDB в Google Play.