Arquivo PDB (o que é e como abri-lo)

UMA Arquivo com o PDB extensão de arquivo é provavelmente um arquivo de banco de dados de programa usado para conter informações de depuração sobre um programa ou módulo, como um DLL ou Exe Arquivo. Às vezes, são chamados de arquivos de símbolo.

O arquivo mapeia vários componentes e instruções no código-fonte para seu produto final compilado, que o depurador pode então usar para encontrar o arquivo de origem e o local no executável onde deve parar a depuração processo.

Alguns arquivos PDB podem estar no formato de arquivo Protein Data Bank. Estes são simples arquivos de texto que armazenam coordenadas em relação às estruturas das proteínas.

Outros arquivos PDB são provavelmente criados no formato de arquivo Palm Database ou PalmDOC e usados ​​com o PalmOS móvel sistema operacional; alguns arquivos neste formato usam a extensão de arquivo .PRC. Ainda outro formato possível é Tanida Demo Builder.

Como abrir um arquivo PDB

Diferentes programas usam seu próprio arquivo PDB para armazenar dados em algum tipo de formato de banco de dados estruturado, de modo que cada aplicativo é usado para abrir seu próprio tipo.

Geneious, Acelerar, Estúdio visual, e Pegasus são apenas alguns exemplos de programas que podem usar um arquivo PDB como um arquivo de banco de dados. Radare e PDBparse também pode funcionar.

Alguns arquivos PDB são armazenados como texto simples, como os arquivos do banco de dados de depuração do programa Geneious, e são completamente legíveis por humanos se abertos em um editor de texto. Você pode abrir esse tipo de arquivo PDB com qualquer programa que possa ler documentos de texto, como o programa Bloco de notas interno do Windows. Alguns outros visualizadores e editores de arquivos PDB incluem Notepad ++ e Colchetes.

Outros arquivos PDB não são documentos de texto e só são úteis quando abertos com o programa a que se destinam. Por exemplo, se o seu estiver relacionado de alguma forma ao Quicken, tente usar esse software para visualizá-lo ou editá-lo. O Visual Studio espera ver um arquivo PDB na mesma pasta que o arquivo DLL ou EXE.

Você pode visualizar e editar arquivos PDB que são arquivos Protein Data Bank, no Windows, Linux e macOS com Avogadro. Esses programas também podem abrir o arquivo: Jmol, RasMol, QuickPDB, e USCF Chimera. Como se trata de texto simples, você também pode abrir um em um editor de texto.

Palm Desktop deve ser capaz de abrir este arquivo se ele estiver no formato de arquivo Palm Database, mas talvez seja necessário primeiro renomeá-lo para ter a extensão de arquivo .PRC para que o programa o reconheça. Calibre é outra opção.

Para abrir um arquivo PalmDOC PDB, tente STDU Viewer.

Arquivos Tanida Demo Builder abertos com um programa que tem o mesmo nome.

Como converter um arquivo PDB

Os arquivos do banco de dados do programa provavelmente não podem ser convertidos para um formato de arquivo diferente, pelo menos não com um ferramenta de conversão de arquivo regular. Em vez disso, se houver alguma ferramenta que possa converter esse tipo de arquivo, será o mesmo programa que pode abri-lo.

Por exemplo, se você precisar converter seu arquivo de banco de dados do Quicken, tente usar esse programa para fazer isso. Este tipo de conversão, no entanto, provavelmente não é apenas de pouca utilidade, mas também não é suportado por estes aplicativos de banco de dados (ou seja, você provavelmente não precisa converter este tipo de arquivo PDB para qualquer outro formato).

Os arquivos do banco de dados de proteínas podem ser convertidos para outros formatos com MeshLab. Para fazer isso, você deve primeiro convertê-lo para WRL com PyMOL de Arquivo > Salvar imagem como > VRML menu e, em seguida, importe o arquivo WRL para o MeshLab e use o Arquivo > Exportar malha como menu para converter o arquivo PDB em STL ou outro formato de arquivo.

Se você não precisa que o modelo seja colorido, você pode exportar o arquivo diretamente para STL com USCF Chimera (o link de download está acima). Caso contrário, você pode usar o mesmo método acima (com MeshLab) para converter PDB em WRL com USCF Chimera e, em seguida, exportar WRL para STL com MeshLab.

Para converter PDB para PDF ou EPUB, se você tiver um arquivo PalmDOC, é possível de várias maneiras, mas a mais fácil provavelmente é usar um conversor online como Zamzar. Você pode enviar seu arquivo para esse site para ter a opção de convertê-lo para esses formatos, bem como para AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT e outros formatos de arquivo de e-book.

Para converter o arquivo PDB para o formato FASTA pode ser feito com PDB online para conversor FASTA da Meiler Lab.

Também é possível converter este arquivo para CIF (formato de informação cristalográfica) online usando PDBx / mmCIF.

Ainda não consegue abrir o arquivo?

Os arquivos que não estão abrindo com nenhuma das ferramentas acima, provavelmente não são arquivos PDB. O que pode estar acontecendo é que você está interpretando mal a extensão do arquivo; alguns formatos usam um sufixo que se assemelha muito ao PDB quando na verdade não estão relacionados e não funcionam da mesma forma.

Por exemplo, um arquivo PDF é um arquivo de documento, mas a maioria dos programas acima não renderizará o texto e / ou as imagens corretamente se você tentar abrir um com esses programas. O mesmo se aplica a outros arquivos com extensões de grafia semelhante, como DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO e WPD arquivos.

PBD é outro que pertence ao EaseUS Todo Backup programa e, portanto, só é útil quando aberto com esse software.

Se você não tem um arquivo PDB, pesquise a extensão do arquivo que tem o seu arquivo para poder encontrar o programa apropriado que o abre ou converte.

Leitura avançada em arquivos PDB

Você pode ler muito mais sobre os arquivos do banco de dados do programa em GitHub e Wintellect.

Também há mais para aprender sobre os arquivos do Protein Data Bank; Vejo Banco Mundial de Dados de Proteínas e RCSB PDB.

perguntas frequentes

• Como faço para corrigir isso quando o Visual Studio não consegue localizar ou abrir arquivos PDB? Se você vir uma mensagem informando que o Visual Studio não pode encontrar ou abrir o arquivo PDB, tente usar a ferramenta de depuração do Visual Studio. Vamos para Ferramentas > Opções > Depurando > Símbolos e selecione Servidores Microsoft Symbol.
• Como abro um arquivo PDB no Android? Para abrir um arquivo PDB no Android, use um leitor de arquivos de terceiros. Baixe o aplicativo Cool Reader ou qualquer outro leitor com suporte de arquivo PDB no Google Play.