Arquivo FNA (o que é e como abri-lo)

Este artigo explica o que são arquivos FNA, como abri-los e como salvá-los em um formato diferente, como FASTA, GB, VCF, imagens, etc.

O que é um arquivo FNA?

UMA Arquivo com a FNA extensão de arquivo é um arquivo de alinhamento de sequência de proteínas e DNA no formato FASTA que armazena informações de DNA que podem ser usadas por software de biologia molecular.

Os arquivos FNA, especificamente, podem ser usados ​​para conter apenas informações de ácido nucleico, enquanto outros formatos FASTA contêm outros Informações relacionadas ao DNA, como aquelas com o arquivo FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET ou AA extensões.

Esses formatos FASTA baseados em texto surgiram originalmente de um pacote de software com o mesmo nome, mas agora são usados ​​como um padrão em aplicações de alinhamento de sequências de DNA e proteínas.

Como abrir um arquivo FNA

Os arquivos FNA podem ser abertos nos sistemas operacionais Windows, Mac e Linux com Geneious (é gratuito por 14 dias). Para fazer isso, navegue até o Arquivo > Importar menu e escolha importar o arquivo FNA através do De arquivo item do menu.

Você também pode abrir arquivos FNA com BLAST Ring Image Generator (BRIG).

Tente abri-lo com Notepad ++ ou outro editor de texto se as idéias acima não estiverem funcionando. O arquivo pode realmente ser baseado em texto e simples de ler, ou você pode descobrir que não tem nada a ver com o formato FASTA, no qual O caso de abrir o arquivo como um documento de texto pode revelar o texto que identifica o que foi usado para criar o arquivo ou o formato do arquivo no.

Como converter um arquivo FNA

Não podemos verificar isso, pois não tentamos, mas você deve ser capaz de usar Geneious para converter um arquivo FNA para muitos outros formatos, como FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV e VCF. Isso pode ser feito através do programa Arquivo > Exportar cardápio.

Geneious também deve ser capaz de converter o arquivo em uma imagem no PNG, JPG, EPS, ou PDF formato via Arquivo > Salvar como arquivo de imagem.

Embora normalmente você não possa simplesmente renomear a extensão de um arquivo para outra coisa e esperar que funcione da mesma maneira, você posso renomeie um arquivo .FNA para um arquivo .FA se o seu software de sequenciamento de DNA específico reconhecer apenas o formato FA.

Ainda não consegue abrir?

Se depois de usar os programas acima, você ainda não conseguir abrir o arquivo, poderá descobrir que a extensão do arquivo não é realmente .FNA, mas algo que apenas visual semelhante.

Por exemplo, os arquivos FNG (Font Navigator Group) são muito parecidos com os que dizem ".FNA", mas se você olhar de perto, apenas as duas primeiras letras são iguais. Como as extensões dos arquivos são diferentes, é uma indicação de que eles são de um formato de arquivo diferente e provavelmente não funcionarão com os mesmos programas.

O mesmo pode ser dito para muitas outras extensões de arquivo como FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), GORDURA, FNTA (Aleph One Font), FNC (Funções Vue) e FND (Pesquisa salva do Windows).

A ideia aqui é apenas garantir que a extensão do arquivo seja .FNA. Se isso acontecer, tente novamente usar os programas acima para abri-lo ou convertê-lo. Se você tiver um tipo diferente de arquivo, pesquise a extensão do arquivo para descobrir quais aplicativos são necessários para abri-lo ou convertê-lo.