Αρχείο FNA (Τι είναι και πώς να ανοίξετε ένα)

Τι να ξέρετε

  • Ένα αρχείο FNA είναι ένα αρχείο FASTA Format DNA και Protein Sequence Alignment.
  • Ανοίξτε ένα με γενναιόδωρο.
  • Μετατροπή σε FASTA και παρόμοιες μορφές με το ίδιο πρόγραμμα.

Αυτό το άρθρο εξηγεί τι είναι τα αρχεία FNA, πώς να ανοίξετε ένα και πώς να αποθηκεύσετε ένα σε διαφορετική μορφή όπως FASTA, GB, VCF, εικόνες κ.λπ.

Τι είναι ένα αρχείο FNA;

ΕΝΑ αρχείο με την FNA επέκταση αρχείου είναι ένα αρχείο FASTA Format DNA and Protein Sequence Alignment που αποθηκεύει πληροφορίες DNA που μπορούν να χρησιμοποιηθούν από λογισμικό μοριακής βιολογίας.

Τα αρχεία FNA, συγκεκριμένα, μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τη διατήρηση μόνο πληροφοριών νουκλεϊκού οξέος, ενώ άλλες μορφές FASTA περιέχουν άλλες Πληροφορίες που σχετίζονται με το DNA, όπως αυτές με το αρχείο FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET ή AA επεκτάσεις.

Αυτές οι μορφές FASTA που βασίζονται σε κείμενο προέκυψαν αρχικά από ένα πακέτο λογισμικού με το ίδιο όνομα, αλλά τώρα χρησιμοποιούνται ως πρότυπο σε εφαρμογές ευθυγράμμισης αλληλουχιών DNA και πρωτεϊνών.

Αρχεία FNA στα Windows 10
Αρχεία FNA.

Το FNA αναφέρεται επίσης σε ορισμένους τεχνολογικούς όρους που δεν έχουν καμία σχέση με αυτήν τη μορφή αρχείου, όπως τελική αποδοχή δικτύου, εγκατάσταση επαύξησης ονόματος/χαρακτηριστικού αρχείου, αρχιτεκτονική δικτύου Fujitsu, και γρήγορη διαφήμιση γείτονα.

Πώς να ανοίξετε ένα αρχείο FNA

Τα αρχεία FNA μπορούν να ανοίξουν σε λειτουργικά συστήματα Windows, Mac και Linux με γενναιόδωρο (είναι δωρεάν για 14 ημέρες). Για να το κάνετε αυτό, μεταβείτε στο Αρχείο > Εισαγωγή μενού και επιλέξτε να εισαγάγετε το αρχείο FNA μέσω του Από το Αρχείο στοιχείο μενού.

Ίσως μπορείτε επίσης να ανοίξετε αρχεία FNA με BLAST Ring Image Generator (BRIG).

Δοκιμάστε να το ανοίξετε με Σημειωματάριο ++ ή άλλο πρόγραμμα επεξεργασίας κειμένου, εάν οι παραπάνω ιδέες δεν λειτουργούν. Το αρχείο μπορεί πράγματι να βασίζεται σε κείμενο και να είναι απλό στην ανάγνωση, ή μπορεί να διαπιστώσετε ότι δεν έχει καμία σχέση με τη μορφή FASTA, στην οποία Η περίπτωση ανοίγματος του αρχείου ως έγγραφο κειμένου μπορεί να αποκαλύψει κείμενο που προσδιορίζει τι χρησιμοποιήθηκε για τη δημιουργία του αρχείου ή ποια μορφή είναι το αρχείο σε.

Εάν διαπιστώσετε ότι μια εφαρμογή στον υπολογιστή σας προσπαθεί να ανοίξει το αρχείο FNA αλλά είναι λάθος εφαρμογή ή εάν προτιμάτε να ανοίξετε αρχεία FNA ένα άλλο εγκατεστημένο πρόγραμμα, μπορείτε αλλάξτε το προεπιλεγμένο πρόγραμμα για μια συγκεκριμένη επέκταση αρχείου στα Windows.

Πώς να μετατρέψετε ένα αρχείο FNA

Δεν μπορούμε να το επαληθεύσουμε επειδή δεν το έχουμε δοκιμάσει, αλλά θα πρέπει να μπορείτε να χρησιμοποιήσετε το Geneious για να μετατρέψετε ένα αρχείο FNA σε πολλές άλλες μορφές, όπως FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV και VCF. Αυτό μπορεί να γίνει μέσω του προγράμματος Αρχείο > Εξαγωγή μενού.

Το Geneious θα πρέπει επίσης να μπορεί να μετατρέψει το αρχείο σε εικόνα στο PNG, JPG, EPS, ή PDF μορφή μέσω Αρχείο > Αποθήκευση ως αρχείο εικόνας.

Αν και συνήθως δεν μπορείτε απλώς να μετονομάσετε την επέκταση ενός αρχείου σε κάτι άλλο και να περιμένετε να λειτουργεί με τον ίδιο τρόπο, μπορώ μετονομάστε ένα αρχείο .FNA σε αρχείο .FA, εάν το συγκεκριμένο λογισμικό αλληλουχίας DNA σας αναγνωρίζει μόνο τη μορφή FA.

Αντί να μετονομάσετε τις επεκτάσεις αρχείων, θα θέλετε να χρησιμοποιήσετε α δωρεάν μετατροπέας αρχείων για να μετατρέψετε άλλους τύπους αρχείων. Στην περίπτωση των αρχείων FNA και FA, τυχαίνει ορισμένα προγράμματα να ανοίγουν μόνο αρχεία που έχουν την επέκταση αρχείου FA, οπότε η μετονομασία του θα πρέπει να λειτουργεί καλά.

Ακόμα δεν μπορείτε να το ανοίξετε;

Εάν μετά τη χρήση των προγραμμάτων από πάνω, εξακολουθείτε να μην μπορείτε να ανοίξετε το αρχείο σας, μπορεί να διαπιστώσετε ότι η επέκταση αρχείου δεν διαβάζει στην πραγματικότητα .FNA αλλά κάτι που απλώς φαίνεται παρόμοιος.

Για παράδειγμα, τα αρχεία FNG (Font Navigator Group) μοιάζουν πολύ σαν να λένε ".FNA", αλλά αν κοιτάξετε προσεκτικά, μόνο τα δύο πρώτα γράμματα είναι ίδια. Δεδομένου ότι οι επεκτάσεις αρχείων είναι διαφορετικές, είναι ένδειξη ότι έχουν διαφορετική μορφή αρχείου και πιθανότατα δεν θα λειτουργούν με τα ίδια προγράμματα.

Το ίδιο θα μπορούσε να ειπωθεί για πολλές άλλες επεκτάσεις αρχείων όπως ΦΑΞ, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), ΛΙΠΟΣ, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) και FND (Windows Saved Search).

Η ιδέα εδώ είναι απλώς να βεβαιωθείτε ότι η επέκταση αρχείου διαβάζει .FNA. Εάν το κάνει, δοκιμάστε ξανά να χρησιμοποιήσετε τα προγράμματα από πάνω για να το ανοίξετε ή να το μετατρέψετε. Εάν έχετε διαφορετικό είδος αρχείου, αναζητήστε την επέκταση αρχείου για να μάθετε ποιες εφαρμογές χρειάζονται για να το ανοίξετε ή να το μετατρέψετε.

FAQ

  • Πώς ανοίγετε ένα αρχείο FNA στην Python;

    Αρχικά, μετατρέψτε το αρχείο FNA σε μορφή FASTA χρησιμοποιώντας μια εφαρμογή τρίτου κατασκευαστή, όπως π.χ γενναιόδωρο. Τότε μπορείς κατεβάστε το Biopython, ένα σύνολο ελεύθερα διαθέσιμων εργαλείων για βιολογικούς υπολογισμούς για εργασία στη βιοπληροφορική. Τελικά, ανατρέξτε στο Βιβλίο Μαγειρικής και Βιοπύθων για οδηγίες σχετικά με την εργασία με αρχεία FASTA.

  • Πώς μπορώ να βρω τους αριθμούς του κατασκευαστή FNA σε ένα ακατέργαστο αρχείο Ancestry;

    Μπορείτε να κάνετε λήψη των περισσότερων δεδομένων DNA από το Ancestry.com σε μορφή .txt. Ωστόσο, μόνο πελάτες των οποίων το DNA αναλύθηκε με αλληλουχία επόμενης γενιάς (NGS) έχουν την επιλογή να κατεβάσουν ένα αρχείο VCF. Για να πραγματοποιήσετε λήψη ενός αρχείου VCF, πρέπει να είστε ο κάτοχος του DNA, να έχετε υποβληθεί σε έλεγχο DNA με χρήση τεχνολογίας NGS και να έχετε τουλάχιστον 350 MB διαθέσιμο χώρο στη συσκευή σας.