Soubor FNA (co to je a jak jej otevřít)
Co vědět
- Soubor FNA je soubor zarovnání DNA a proteinové sekvence formátu FASTA.
- Otevřete jednu pomocí Geniální.
- Převeďte do FASTA a podobných formátů pomocí stejného programu.
Tento článek vysvětluje, co jsou soubory FNA, jak je otevřít a jak je uložit do jiného formátu, jako je FASTA, GB, VCF, obrázky atd.
Co je soubor FNA?
A soubor s FNA přípona souboru je soubor FASTA Format DNA a Protein Sequence Alignment, který ukládá informace o DNA, které mohou být použity softwarem molekulární biologie.
Konkrétně soubory FNA mohou být použity pouze k uložení informací o nukleové kyselině, zatímco jiné formáty FASTA obsahují jiné Informace související s DNA, jako jsou ty se souborem FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET nebo AA rozšíření.
Tyto textové formáty FASTA původně vznikly ze softwarového balíku se stejným názvem, ale nyní se používají jako standard v aplikacích pro srovnání DNA a proteinových sekvencí.
FNA také odkazuje na některé technologické termíny, které nemají nic společného s tímto formátem souboru, např
Jak otevřít soubor FNA
Soubory FNA lze otevřít v operačních systémech Windows, Mac a Linux Geniální (je to zdarma na 14 dní). Chcete-li to provést, přejděte na Soubor > Import a zvolte import souboru FNA přes Ze souboru položka nabídky.
Můžete také otevřít soubory FNA pomocí BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Zkuste to otevřít pomocí Poznámkový blok++ nebo jiný textový editor, pokud výše uvedené nápady nefungují. Soubor může být skutečně textový a snadno čitelný, nebo můžete zjistit, že nemá nic společného s formátem FASTA, ve kterém případ otevření souboru jako textového dokumentu může odhalit text, který identifikuje, co bylo použito k vytvoření souboru nebo jaký je formát souboru v.
Pokud zjistíte, že se nějaká aplikace ve vašem PC pokouší otevřít soubor FNA, ale jde o nesprávnou aplikaci, nebo pokud byste raději nechali jiný nainstalovaný program otevřít soubory FNA, můžete změnit výchozí program pro konkrétní příponu souboru ve Windows.
Jak převést soubor FNA
Nemůžeme to ověřit, protože jsme to nezkoušeli, ale měli byste být schopni použít Geneious k převodu souboru FNA do mnoha dalších formátů, jako jsou FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV a VCF. To lze provést prostřednictvím programu Soubor > Vývozní Jídelní lístek.
Geneious by také měl být schopen převést soubor na obrázek v PNG, JPG, EPS, nebo PDF formátovat přes Soubor > Uložit jako soubor obrázku.
Ačkoli normálně nemůžete jednoduše přejmenovat příponu souboru na něco jiného a očekávat, že bude fungovat stejným způsobem, umět přejmenujte soubor .FNA na soubor .FA, pokud váš konkrétní software pro sekvenování DNA rozpozná pouze formát FA.
Místo přejmenování přípon souborů budete chtít použít a bezplatný převodník souborů pro převod jiných typů souborů. V případě souborů FNA a FA se jen tak stane, že některé programy otevřou pouze soubory, které mají příponu FA, v takovém případě by přejmenování mělo fungovat dobře.
Stále to nejde otevřít?
Pokud po použití výše uvedených programů stále nemůžete soubor otevřít, možná zjistíte, že přípona souboru ve skutečnosti nečte .FNA, ale místo toho něco, co vzhled podobný.
Například soubory FNG (Font Navigator Group) vypadají strašně, jako by říkaly „.FNA“, ale když se podíváte pozorně, pouze první dvě písmena jsou stejná. Protože se přípony souborů liší, znamená to, že mají jiný formát souboru a pravděpodobně nebudou fungovat se stejnými programy.
Totéž lze říci o mnoha dalších příponách souborů, jako je FAX, FAS (kompilovaný Fast-Load AutoLISP), TLUSTÝ, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) a FND (Windows Saved Search).
Cílem je pouze zajistit, aby přípona souboru byla .FNA. Pokud ano, zkuste jej znovu otevřít nebo převést pomocí programů shora. Pokud máte jiný typ souboru, prozkoumejte příponu souboru a zjistěte, které aplikace jsou potřeba k jeho otevření nebo převodu.
FAQ
-
Jak otevřete soubor FNA v Pythonu?
Nejprve převeďte soubor FNA do formátu FASTA pomocí aplikace třetí strany, jako je např Geniální. Potom můžeš Stáhněte si Biopython, soubor volně dostupných nástrojů pro biologické výpočty pro práci v bioinformatice. Konečně, viz Návod a kuchařka Biopython pokyny pro práci se soubory FASTA.
-
Jak najdu svá čísla výrobce FNA v souboru Ancestry raw?
Většinu dat DNA si můžete stáhnout z Ancestry.com ve formátu .txt. Pouze zákazníci, jejichž DNA byla analyzována pomocí sekvenování nové generace (NGS), však mají možnost stáhnout soubor VCF. Chcete-li stáhnout soubor VCF, musíte být vlastníkem DNA, musíte mít DNA testovanou pomocí technologie NGS a mít na svém zařízení k dispozici alespoň 350 MB místa.